En 1308 Robert Bruce quebró el poder de los Comyn en el norte. El breve relato de HES para visitantes le atribuye la toma de Balvenie, mientras que su Statement of Significance detallado no resuelve si el castillo fue dañado deliberadamente y señala una laguna documental posterior de aproximadamente un siglo. La toma, los daños a las defensas y el cambio de propietario son cuestiones distintas; esa laguna no permite establecer su secuencia exacta.
En 1408, Balvenie aparece documentado entre las posesiones de los Douglas Negros. La confiscación de sus bienes en 1455 trajo otro traspaso de poder y la finca pasó posteriormente a John Stewart, futuro conde de Atholl. Estos cambios explican la sucesión de familias sin exigir que cada muro dañado se asocie a una batalla. La derrota política, la confiscación legal y la destrucción física son hechos distintos que no dejan necesariamente las mismas pruebas.
Hacia mediados del siglo XVI, John Stewart, cuarto conde de Atholl, y su esposa Elizabeth Gordon añadieron el Atholl Lodging. La nueva ala modificó el recinto anterior en lugar de sustituir todo el castillo. Su torre circular de esquina, la decoración heráldica y los elementos salientes de las ventanas proclamaban rango, además de ofrecer alojamiento. La reja de hierro de dos hojas conservada recuerda que una casa más cómoda todavía podía controlar cuidadosamente la entrada.
María Estuardo se alojó en Balvenie en septiembre de 1562 durante su viaje al norte. HES registra dos noches en el castillo, entonces residencia del cuarto conde de Atholl. Es una relación real documentada, no una razón para identificar una habitación conservada como dormitorio de María sin más pruebas. Sitúa una residencia provincial dentro de los desplazamientos y las relaciones políticas de la corte real.
La historia residencial de Balvenie continuó más allá del siglo XVII. Tras varios cambios de propiedad, los Duff estuvieron vinculados a su última etapa como casa. A comienzos del siglo XVIII, una nueva Balvenie House sustituyó al castillo como residencia principal. Las tropas gubernamentales volvieron a utilizar brevemente el castillo en 1746. Por tanto, el abandono como hogar familiar no significó que toda actividad cesara de inmediato.
El castillo pasó a tutela estatal en 1925 y está protegido como monumento de protección especial SM90028. Los primeros trabajos de limpieza alteraron depósitos arqueológicos, pero no eliminaron toda huella de ocupación anterior. Una intervención limitada en 1990 identificó un horno posiblemente relacionado con la elaboración de cerveza, junto con fosas anteriores al ala contigua. Esa función posible pertenece a las pruebas del trabajo cotidiano en el lugar; no demuestra la existencia de una destilería medieval de whisky.
Empieza fuera, donde el recinto y el foso conservado facilitan comprender la disposición defensiva. Dentro, compara los muros antiguos con el Atholl Lodging y los vestigios de las alas domésticas. Algunas estructuras solo sobreviven como cimientos y sus funciones propuestas siguen siendo interpretaciones. Comprueba el acceso actual antes de viajar y respeta los avisos de conservación. La historia más poderosa de Balvenie es la adaptación de una fortaleza heredada a lo largo de siglos, con las lagunas de su documentación reconocidas honestamente en lugar de rellenadas con una secuencia inventada de conquistas.